همسانه سازی و بررسی ژن های شبه سایکلوتاید در ذرت

نویسندگان

سمیرا ترکمن

دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندج بهمن بهرام¬نژاد

استادیار گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندج نازنین کودری

دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندج

چکیده

سایکلوتایدها دسته­ای بزرگ از پپتیدهای حلقوی هستند که فعالیت­های زیستی متنوعی دارند. از جمله می­توان به فعالیت ضد میکروبی، ضدتوموری، ضدویروسی، تخریب گلبولهای قرمز، سلول­کشی و حشره­کشی اشاره کرد. شبه­ سایکلوتاید ها در گیاهان به صورت خانواده ژنی بیان شده و دارای نواحی حفاظت شده می­باشند. در این پژوهش بر اساس توالی نواحی حفاظت­شده پروتئین آغازگر طراحی شد و با استفاده از تکنیکrace-pcr '3 ژن های کدکننده پروتئین های شبه سایکلوتاید در ذرت همسانه سازی و تعیین توالی شدند. مقایسه توالی­های به­دست آمده با توالی­های موجود در پایگاه داده­های ژنی  pgi نشان داد که تعداد نه ژن شبه­سایکلوتاید جدید در ذرت به­دست آمده است. مقایسه توالی نوکلئوتیدی و اسیدآمینه­ای این ژن­ها آنها را به دو دسته تقسیم کرد. دسته اول شباهت زیادی با سایر شبه­ سایکلوتاید های موجود در پایگاه داده­های ژنی داشته و‏‏ دارای نواحی حفاظت ­شده سایکلوتایدی بودند. دسته دوم دارای ساختار منظم سایکلوتایدی نبودند و تعداد نوکلئوتید های این دو دسته از 485-413 متغیر بود. این اولــین گزارش در زمینه همسـانه­سازی ژن­های شبه­سایکلوتاید در گرامینه­ها بود و نشان داد که ذرت تنوع بالایی از این ژن­ها دارد.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

همسانه¬سازی و بررسی ژن های شبه سایکلوتاید در ذرت

سایکلوتایدها دسته­ای بزرگ از پپتیدهای حلقوی هستند که فعالیت­های زیستی متنوعی دارند. از جمله می­توان به فعالیت ضد میکروبی، ضدتوموری، ضدویروسی، تخریب گلبولهای قرمز، سلول­کشی و حشره­کشی اشاره کرد. شبه­ سایکلوتاید ها در گیاهان به صورت خانواده ژنی بیان شده و دارای نواحی حفاظت شده می­باشند. در این پژوهش بر اساس توالی نواحی حفاظت­شده پروتئین آغازگر طراحی شد و با استفاده از تکنیکrace-pcr '3 ژن های کدکن...

متن کامل

همسانه سازی و مطالعه ژنهای شبه سایکلوتاید در گندم

سایکلوتایدها دسته ای از پروتئین های کوچک غنی از سیستئین می باشند و این پپتیدها حدود 30 اسیدآمینه دارند. در آن ها یک ساختار منحصر به فرد به وسیله سه باند دی سولفید، به نام گره سیستئینی ایجاد می شود. سایکلوتایدها خانواده بزرگی از پپتیدهای حلقوی ضد میکروبی هستند که فعالیت های زیستی متنوعی دارند که از جمله می توان به فعالیت ضدمیکروبی، ضدتوموری، ضدویروسی، از بین بردن گلبول های قرمز، سلول کشی و حشره ...

15 صفحه اول

بررسی بیان ژن های شبه سایکلوتاید zm cycl 1 و zm cycl 5 در گیاه ذرت

سایکلوتایدها گروهی از پپتیدهای ضد¬میکروبی گیاهی هستند که به¬دلیل وجود خواص ساختاری منحصر به¬فرد از قبیل اتصال انتهای c و n و ساختار حلقوی، در کنار 6 عدد سیستئین حفظ شده و 3 پل دی¬سولفیدی دارای خواص زیستی متنوعی مانند سمیت زدایی سلولی، فعالیت ضد¬میکروبی، ضد سرطانی، حشره¬کشی، نماتد کشی و نرم¬تن کشی هستند. این پپتیدها اغلب در گونه¬های دو لپه¬ی¬ و غیر زراعی کشف و بررسی شده¬ند، و بیشتر مطالعات انجام...

شناسایی و همسانه سازی ژن داخلی مناسب پنبه در راستای افزایش کارایی بررسی های مولکولی

ژن داخلی مناسب در بررسی کیفیت DNA ژنوم و آنالیز محصولات تراریخته از اهمیت فراوانی برخوردار است. در این پژوهش، به­منظور دستیابی به ژن داخلی مناسب در پنبه، از ژن SadI استفاده شد. ابتداDNA  ژنومی استخراج گردید، سپس با استفاده از آغازگرهای اختصاصی طراحی­شده با نرم‌افزار Vector NTI، واکنش PCR انجام گرفت. محصول واکنش PCR دو قطعه 623 و 544 جفت­بازی بود. قطعات موردنظر در پلاسمید pTZ57R/T همسانه شدند. پ...

متن کامل

همسانه سازی، بیان و ارزیابی عملکرد پروتئین شبه الاستین: پروتئین نوین در مهندسی پزشکی

Introduction: Elastin like protein or ELP is a synthetic biopolymer consisting the pentapeptide repeats of VPGXG (X can be any amino acid except Pro). This protein is the thermal responsive polypeptide that undergoes a reversible phase transition. At a temperature below the transition temperature (Tt), ELP molecules assume an extended conformation and thus are soluble in aqueous solution; but u...

متن کامل

همسانه سازی، بررسی بیوانفورماتیکی و بیان ژن زیر واحد اصلی فاکتور کلونیزاسیون I اشرشیاکولی انتروتوکسیژنیک (ETEC

زمینه و هدف: اشرشیاکولی انتروتوکسیژنیک (ETEC) عامل اصلی اسهال کودکان در کشورهای در حال توسعه و مسافران به این مناطق می‌باشد. از طریق ساختارهای سطحی به نام فاکتورهای کلونیزاسیون به سلول‌های میزبان متصل می شود. اشرشیاکولی انتروتوکسیژنیک در بسیاری از مناطق شیوع فاکتور کلونیزاسیون نوع یک (CFA/I) از سایر فاکتورهای کلونیزاسیون بیشتر می باشد و این ترکیب به عنوان ترکیب کلیدی در تولید واکسن محسوب می‌گرد...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید


عنوان ژورنال:
فن آوری زیستی در کشاورزی

جلد ۳، شماره ۲، صفحات ۴۱-۵۰

کلمات کلیدی

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023